發展食用菌生產控制雜菌污染是一個非常重要的環節。所謂雜菌就是指在培養基上生長的、非特定培養的食用菌之外的一切抑制或防礙食用菌正常生長的微生物，統稱為雜菌。一般減少雜菌污染主要措施： 

1、成團、結塊的培養料要打碎、培養料要先發酵或石灰水處理。 

2、母種、原種培養棉塞不能吸濕污染，松緊要適中，過松易進雜菌。 

3、高壓滅菌要注意要壓力、溫度、時間關系。要掌握好二次排氣，母種試管滅菌不低于半小時，原種不少于1小時。常壓滅菌達計時溫度后不少于10小時。 

4、接種時一定要嚴格按無菌操作要求進行，不能減少程序，盡可能減少污染源。 

5、培養室要通風干燥、及時消毒。 

6、防止雜菌污染應貫徹預防為主，藥物為輔的方針，才能減少污染，提高產量，降低成本，改善品質，保障食用者的安全和健康。 

7、常見的雜菌：高溫季節常見鏈孢霉（紅色面包霉），綠色木霉，初期為白色，后變綠色，根霉初為白色，后變灰白色到黑色；青霉菌絲呈掃帚狀，還有曲霉、毛霉和鬼傘類雜菌。防止的根本辦法在于每個環節嚴格操作，發病后及時發現，采取措施，防止擴散傳播為害，